ميكروأري مقرها التهجين الجينومي المقارن (صفيف [ك]) بالكشف عن الحذف الكروموسومات دون المجهرية والازدواجية في المرضى الذين يعانون من صعوبات التعلم / الت

[رافت ابراهيم]

 

http://jmg.bmj.com/content/41/4/241.full

https://translate.googleusercontent....KuerPlgUX4LbnQ


ملخص

الأسباب الكامنة وراء العجز عن التعلم وتشوه الملامح في العديد من المرضى لا تزال مجهولة على الرغم من التحقيق واسعة النطاق. تحليل النمط النووي الروتيني ليست حساسة بما يكفي للكشف عن إعادة ترتيب الكروموسومات خفية (أقل من 5 ميغابايت). تم التحقيق وجود خفية تغييرات في عدد النسخ الحمض النووي عن طريق صفيف [ك] في 50 المرضى الذين يعانون من صعوبات التعلم وخلل البنية؛ شوهة، وتوظيف ميكروأري DNA شيدت من الحيوانات المستنسخة إدراج كبيرة متباعدة في ما يقرب من 1 ميغابايت فترات عبر الجينوم. وتم تحديد اثني عشر نسخة تشوهات العدد في 12 مريضا (24٪ من المجموع): سبعة الحذف (على ما يبدو من جديد واحدة ست الموروثة من أحد الوالدين الطبيعي ظاهريا) وخمسة الازدواجية (واحد من جديد وأربعة الموروثة من الآباء والأمهات العادي ظاهريا). وتراوحت شرائح تغيير في حجمها من تلك التي تنطوي على استنساخ واحد لمناطق كبيرة مثل 14 ميجا بايت. وقد تم تحديد أي حذف المتكرر أو الازدواجية داخل هذه الفئة من المرضى. على أساس هذه النتائج، ونحن نتوقع أن أن صفيف CGH تصبح طريقة روتينية للفحص الجينوم على نطاق لإعادة ترتيب متوازن في الأطفال الذين يعانون من صعوبات التعلم.
وكثيرا ما يرتبط اختلال الكروموسومات الدستوري مع العجز عن التعلم، خلل البنية؛ شوهة، التشوهات الخلقية، وتشوهات النمو. أمثلة من الاختلالات الكروموسومية المتكررة وتشمل الشروط جيدا اتسم مثل trisomies المشتركة، والتي يمكن دراستها من خلال تقنيات الوراثية الخلوية الكلاسيكية. ومع ذلك، فإن هذه الطرق دقة محدودة وغير موثوقة لإجراء تغييرات في عدد النسخ خفية تشمل قطاعات الكروموسوم من 5 ميجا بايت في طول أو أقل.
microdeletion الكروموسومات أو ازدواجية المتلازمات المتكررة، مثل على سبيل المثال متلازمة دي جورج (متلازمة حذف 22q11)، قد يكون سريريا التعرف عليها بسبب مزيج من المظاهر السريرية أو بسبب مظهر الوجه المميز ("الجشطالت"). في المرضى الذين يعانون من كروتب] طبيعية، قد المظاهر السريرية لا تزال تدل على المناطق المناسبة ليتم عرضه لاختلال التوازن المجهرية التي كتبها الفلورسنت تهجين الموقع (FISH) تحليل في استخدام موضع تحقيقات محددة. في كثير من الأحيان، ومع ذلك، فإن الجمع بين المظاهر السريرية ليس التشخيص من متلازمة معينة ولكن يمكن مع ذلك لا تزال تشير إلى أن الخلل الكروموسومي هو السبب المرجح الكامنة وراء الشذوذ. أعطت تحقيقات FISH تهدف إلى الكشف عن إعادة ترتيب subtelomeric العائد التشخيص كبير من حوالي 6٪ في المرضى الذين يعانون من صعوبات التعلم غير المبررة والميزات تشوه، 1- 3 ولكن الخلالي الحذف الكروموسومات والازدواجية لا يمكن اكتشافها باستخدام هذا الأسلوب.
وفي الآونة الأخيرة، تم تطبيق تقنية التهجين الجينومي المقارن ([ك]) باستخدام الكروموسومات الطورية لهذه المشكلة السريرية. 4، 5 وقد تم تنقيح حساسيتها للسماح الكشف عن الحذف الكروموسومات صغيرة مثل 3 ميجا بايت. في دراسة أجريت على المرضى الذين يعانون من صعوبات في التعلم وخلل البنية؛ شوهة، أظهرت 10٪ الحذف صغيرة أو الازدواجية التي كانت كشفها بواسطة هذه الطريقة ولكن التي لم يتم التعرف على G النطاقات النمط النووي. 4
ميكروأري مقرها التهجين الجينومي المقارن (صفيف [ك]) 6 والعديد من المزايا المحتملة على الطرق الأخرى المتاحة حاليا للتحقيق من الأطفال الذين يعانون من صعوبات التعلم وخلل البنية؛ شوهة. ويقدم تحليل الجينوم على نطاق السريع بدقة عالية والمعلومات التي يقدمها يرتبط مباشرة إلى خرائط الفيزيائية والوراثية للجينوم البشري.
وقد استخدمت مجموعة، [ك] بنجاح لتحليل عينات الأورام وخطوط الخلايا 7- 12 وللتحليل عالية الدقة من تشوهات الدستورية التي تتكون من المكاسب نسخة واحدة والخسائر في المناطق الكروموسومي، 13- 15 التيلوميرات، 16 وكروموسوم كامل. 17 وقد ذكرت دراسة استخدام الجينوم على نطاق صفيف CGH للتحقيق في المرضى الذين يعانون من خلل البنية؛ شوهة والعجز عن التعلم في الآونة الأخيرة. 18 وفي تلك الدراسة، خمسة عدد النسخ التغيرات اثنان منها فقط كانت دي نوفو واحد ينطوي على إعادة ترتيب داخل telomeric المنطقة كانت وجدت في 20 مريضا، وإعطاء محصول التشخيص المحتمل لل15٪.
لقد ذكرت سابقا تصميم واستخدام ميكروأرس الحمض النووي للكشف عن عدد النسخ يتغير 10 مع تطبيق لخلل وراثي خلوي، 19 واستخدمت نسخة معدلة من هذه التقنية لتحديد نقاط التوقف في الأشخاص الذين يعانون نقل المواقع متبادلة متوازنة. 20 ونحن هنا تقرير تطبيق على نطاق الجينوم صفيف [ك] في 1 ميغابيت لدراسة 50 مريضا مع العجز عن التعلم وخلل البنية؛ شوهة الذين، في معظم الحالات، قد استبعدت إعادة ترتيب telomeric.

 

[رافت ابراهيم]

 

ويرتبط Microdeletion تشمل MAPT في الكروموسوم 17q21.3 مع تأخر في النمو وصعوبات التعلم

تشارلز شو Smith1،8، آلان M Pittman2،8، ليونيل Willatt3،8، هوارد Martin4، ليزا Rickman1، سوزان Gribble5، ريبيكا Curley5، سالي Cumming4، كارولين Dunn3، ديميتريوس Kalaitzopoulos5، كيث Porter5، ايلينا Prigmore5، آنا CV-Santos6 Krepischi مونيكا C Varela7، سيليا P Koiffmann7، أندرو J Lees2، كارلا Rosenberg6، هيلين V Firth1، روهان دي Silva2 ونايجل P Carter5

ملخص

مؤخرا، وتطبيق مجموعة مقرها التهجين الجينومي المقارن (مجموعة [ك]) قد تحسنت معدلات الكشف عن الاختلالات الكروموسومية في الأفراد ذوي التخلف العقلي وتشوه features1، 2، 3، 4. هنا، نحن تصف ثلاثة أشخاص مع العجز عن التعلم ومتخالف الحذف في كروموسوم 17q21.3، الكشف عن في كل حالة من قبل مجموعة [ك]. أظهر تحليل FISH أن الحذف وقعت كما دي نوفو الأحداث في كل فرد وكانت بين 500 كيلو بايت و 650 كيلو بايت في الحجم. ووصف مؤخرا 900 كيلو بايت انعكاس أن يقمع إعادة التركيب بين H1 H2 الأجداد وhaplotypes5 يشمل الحذف. وتبين لنا أن في كل الثلاثي، والد أصل كروموسوم حذف 17 يحمل واحد على الأقل H2 كروموسوم. هذه المنطقة من 17q21.3 معارض العمارة الجينومية معقدة مع موصوفة وصفا جيدا يكرر-نسخة منخفضة (LCRS) 5، 6. التوجه من LCRS المرافقة الجزء المحذوف في الزيجوت قلب من المرجح أن تسهيل جيل من هذه microdeletion عن طريق عدم إعادة التركيب مثلي أليلية.

http://www.nature.com/ng/journal/v38...ll/ng1858.html

 

[رافت ابراهيم]

 

http://www.nature.com/neuro/journal/...ll/nn1772.html


https://translate.google.com/transla...tml&edit-text=

لنتائج

وجهة نظرنا على الدولة من الفن في أبحاث عسر القراءة، كما هو موضح في هذا الاستعراض مختصرة من دراسات واسعة النطاق على عسر القراءة التنموي، هو أن وظيفة البديل في أي عدد من الجينات المسؤولة عن تطوير القشرية، بما في ذلك ولكن ربما لا يقتصر على معروف الجينات المرشحة عسر القراءة قابلية DYX1C1، KIAA0319، DCDC2 وROBO1، يمكن أن تكون مسؤولة عن التشوهات القشرية خفية تنطوي على هجرة الخلايا العصبية والنمو محور عصبي، وهذا بدوره يؤدي إلى الدوائر القشرة-القشرية والقشرة المهادية الشاذة التي تؤثر الحسية والعمليات الإدراكية والمعرفية حاسمة ل تعلم. اللدونة المتعلقة بأحداث التنموية القشرية الأولية الناجمة عن وظيفة الجين الشاذة تختلف من حيث السن والجنس، مما أدى إلى الفروق الفردية في النمط الظاهري السلوكية الكبار. ويتركز العمل الجاري بشأن الأحداث الجزيئية الأولية التي تؤدي إلى التشوهات هجرة الخلايا العصبية المرتبطة بالجينات عسر القراءة مرشح، اللدونة التنموية المرتبطة مع الحدث الأولي، والطبيعة التفصيلية للالحسية الناجمة عن ذلك، الإدراك الحسي والإدراكية والاضطرابات السلوكية.