عرض مشاركة واحدة
  #35  
قديم 12-02-2015, 11:12 PM
رافت ابراهيم رافت ابراهيم غير متواجد حالياً
عضو ذهبي
 
تاريخ التسجيل: Dec 2011
المشاركات: 520
افتراضي اختبار لtriallelism: تحليل ستة جينات BBS في بارديه-بيدل فوج الأسرة متلازمة

 

http://www.nature.com/ejhg/journal/v.../5201372a.html

صل على 21 يوليو 2004. المنقحة 25 نوفمبر 2004؛ تقبل 2 ديسمبر 2004. نشرت على الانترنت 16 مارس 2005.

أعلى الصفحة ملخص

يتم تعريف النمط الظاهري من متلازمة بارديه-بيدل (BBS) من قبل جمعية التهاب الشبكية الصباغي، والسمنة، polydactyly، نقص الأعضاء التناسلية، وأمراض الكلى وimpairement المعرفي. ويدعم هذا التباين الوراثي كبير من هذا الشرط من تحديد الهوية، حتى الآن، من ثمانية جينات (BBS 1-8) ضمنية مع الجمعية أهداب أو وظيفة. وقد تم مؤخرا اقترح الميراث Triallelic على أساس تحديد ثلاثة الأليلات تحور في اثنين من الجينات مختلفة لنفس المريض. في لفيف من 27 أسرة، وقد تم دراسة ستة جينات BBS (وهي BBS1، BBS2، BBS4، BBS6، BBS7 وBBS8). وقد تم تحديد الطفرات في 14 عائلة. وقد تم تحديد اثنين من الطفرات في الجين نفسه في سبع عائلات. وأكثر ما يعني ضمنا BBS1 مع استبدال M390R المشترك في الدولة متماثلة اللواقح = 2)، أو المرتبطة طفرة أخرى في BBS1 (ن = 3). تم العثور على الطفرات متخالف مجمع في BBS2 (عائلة واحدة) وBBS6 (عائلة واحدة). في سبع عائلات أخرى، وقد تم تحديد واحد فقط تحور متخالف (مرة واحدة في BBS1، مرتين لBBS2 وثلاث مرات في BBS6). على الرغم من أن الدراسة لم تكشف عن أي الأسر التي لديها طفرات بحسن نية في اثنين من الجينات BBS، بما يتفق مع فرضية triallelic، وجدنا وجود فائض من الطفرات واحدة متخالف. وتؤكد هذه الدراسة عدم التجانس الوراثي للBBS وإشراك الجينات ربما مجهولة.
الكلمات الدالة:

بارديه-بيدل متلازمة، triallelism والجينات BBS

أعلى الصفحة مقدمة

متلازمة بارديه-بيدل (BBS) هي واحدة من متلازمات الأكثر شيوعا المرتبطة التهاب الشبكية الصباغي، وسبب الكلاسيكية من الموروث السمنة المتلازمات في مرحلة الطفولة. 2 يتميز BBS من قبل الجمعيات التالية: المبكر يصيب التهاب الشبكية الصباغي، والسمنة، polydactyly، قصور الغدد التناسلية، صعوبات التعلم والكلى والتشوهات. 4 كم هائل من المعرفة حول BBS قد تراكمت في الآونة الأخيرة، مما يدل على عدم التجانس الوراثي واسعة وإعطاء أدلة عن التسبب الهدبية هذه الحالة المعقدة. وأشير أيضا إلى أن الميراث لها قد تحيد عن راثي الميراث المتنحية الكلاسيكية ويمكن أن تنطوي، في بعض العائلات، ثلاثة الأليلات تحور في اثنين من الجينات (الميراث triallelic). 9
حتى الآن، كانت ثمانية جينات BBSidentified: BBS1 (11q13); 10 BBS2 (16q21); 11 BBS3 (3p12–13); 12 , 13 BBS4 (15q22.3–q23); 14 BBS5 (2q31); 15 BBS6 (20p12); 16 , 17 , 18 BBS7 (4q27); 19 BBS8 (14q32.11). 20 The BBS6 gene كما تم العثور على تحور في متلازمة McKusick كوفمان سريريا ارتباطا وثيقا. 21، 22 الطفرات نقطة في الجينات الثمانية المعروفة تمثل فقط حوالي 50٪ من المرضى BBS، مما يشير إلى أن هناك العديد من أكثر من الجينات التي يمكن العثور عليها.
تحديد BBS8، وبروتين المعنية على مستوى الجسم القاعدية من الخلايا المهدبة مع أي دور في تكون الأهداب أو التوسط التواصل بين هدب والداخلية للخلية، وفتحت الطريق إلى فهم عام من الفوضى خاصة وقد برز تداخل وظيفي كما بين بعض الجينات BBS. 20 وقد تم مؤخرا أظهرت BBS4 لاستهداف البروتينات للمنطقة محيط بالمريكز، وأن تشارك مع رسو أنيبيب وcyle خلية التقدم. 23 الفئران Bbs4 الصفرية يكشف ملامح مشتركة مع النمط الظاهري البشري و يؤكد اتصال مع خلايا مهدبة BBS4. 24 وفي هذه الدراسة، قمنا بتحليل 27 أسرة لمدة ستة جينات BBS (BBS1، BBS2، BBS4، BBS6، BBS7 وBBS8). نحن نؤكد ذلك، وبصرف النظر عن BBS1 وإلى حد أقل BBS6، الجينات الأخرى (بما في ذلك BBS7 حددت مؤخرا وBBS8) تساهم في نسبة صغيرة من المرضى BBS. نعالج أيضا مسألة إمكانية الميراث triallelic digenic في هذه المجموعة.

أعلى الصفحة المرضى والطرق

المرضى BBS

وقد تم اختيار المرضى الذين يعانون من المعايير التشخيصية التي يحددها وجود ثلاثة على الأقل من السمات الرئيسية: التهاب الشبكية الصباغي، والسمنة، polydactyly، قصور الغدد التناسلية، صعوبات التعلم وتشوه الكلى أو الفشل 4
تم تجنيد عائلات 27 (33 مريضا) التي تم تحليلها في هذه الدراسة من الوراثة الطبية الإدارات والأقسام طب العيون الموجودة في جميع أنحاء فرنسا. بين الأسر 27، 19 كانت حالات متفرقة والباقي كان اثنين على الأقل من أفراد المتضررين.
يتم تصنيف الأصل العرقي للعائلات حيث كانت ثلاث عائلات من شمال أفريقيا، وكانت ثلاثة الغجر والباقي (21 أسرة) كانت من أصل قوقازي.
PCR التضخيم من الجينات BBS

تم إجراء استخراج الحمض النووي من عينات الدم عن طريق إجراء المالحة القياسية. تحققت PCR التضخيم من الإكسونات والحدود اكسون-إنترون مع 50 نانوغرام من قالب الحمض النووي الجيني. تم تعديل تسلسل التمهيدي وفقا للأدب. 14، 18، 20، 22 هي PCR البروتوكولات وتسلسل التمهيدي متوفرة عند الطلب.
الكشف عن والمتكررة M390R طفرة BBS1 المتكررة

قمنا بتطوير اختبار تقييد لفحص سريع للمرضى لM390R طفرة المتكررة من BBS1، كما T G تبدال في اكسون 12 يعطل الموقع انشقاق عن جيش التحرير الوطني الليبي III تقييد انزيم (CATG /) (الشكل 1). تم إجراء تحليل PCR من اكسون 12 من BBS1 مع التمهيدي إلى الأمام 5'-CCATCCCCTGTCTTGCTTTC-3 "و التمهيدي العكسي 5'-CATGCTTCATTTCCACCTCC-3" باستخدام 50 نانوغرام من الحمض النووي و10 بمول من كل التمهيدي في معيار 25 ل التفاعل. تم تنفيذ PCR التضخيم في thermocycler هتما Biometra وفقا للشروط التالية: 3 دقيقة عند 94 درجة مئوية، 35 دورة في 94 درجة مئوية لمدة 30 ثانية، 59 درجة مئوية لمدة 30 ثانية، 72 درجة مئوية لمدة 30 ثانية، وخطوة التمديد النهائي في 72 درجة مئوية لمدة 10 دقيقة. 10 تم هضمها لتر من المنتج PCR مع 2 U من جيش التحرير الوطني الليبي الثالث في العازلة المناسبة عند 37 درجة مئوية خلال 3 ساعات.
الشكل 1.

تم تضخيمه الكشف عن المتكررة M390R طفرة BBS1 من قبل جيش التحرير الوطني الليبي III هضم. BBS1 اكسون 12 كما هو موضح وهضم PCR من قبل جيش التحرير الوطني الليبي III تقييد انزيم (CATG /). وT G النتائج طفرة في فقدان الانقسام الطبيعي للPCR جزء 229-BP إلى 121- وشظية 104-BP (والمتبقي 4 بي بي nonvisualized). ملخص من السلطات الوطنية المعينة من الوالدين متخالف يثير العادي 121 و 104 العصابات وعسر الهضم الفرقة 229-BP؛ لم يهضم DNA من الأطفال المتضررين. C هو السيطرة الطبيعية.
الرقم الكامل وأسطورة (44 K)

طفرة فحص من BBS1، BBS2، BBS4، BBS6، BBS7 وBBS8 الجينات

تم إجراء فحص تحور الجينات ستة BBS عن طريق تحليل DHPLC باستخدام ثلاثة على الأقل درجات الحرارة وذوبان لكل amplicon، تليها التسلسل المباشر لمتغير شظايا PCR. للكشف عن الطفرات متماثل، تم إجراء تحليل لاحق من SSCP و / أو عن طريق خلط المنتجات PCR لDHPLC. لوجد المرضى أن تحور في جين BBS، تم تحليل تسلسل الترميز بأكمله المواقع بما في ذلك لصق عن طريق التسلسل المباشر.
تم إجراء التحليل DHPLC على WAVE نوكليك حمض قطعة نظام تحليل (Transgenomic، وشركة). تم تحديد درجات الحرارة وذوبان المثلى (T م) لكل جزء PCR التي كتبها الفردية من كل مجال تمسخ باستخدام البرمجيات WaveMaker 3.3.3 (Trangenomics شركة). لBBS7 وBBS8، كانت مختلطة عينات PCR من اثنين من المرضى لا علاقة لتشكيل heteroduplexes في ما يقرب من نسبة 1: 1 (بعد التحقق من حجم وكمية من المنتجات PCR على 2٪ هلام الاغاروز) عن طريق تسخين العينات المختلطة في 95 درجة مئوية لمدة 8 دقائق ثم التبريد إلى 25 درجة مئوية خلال خفض 0.5 ° C كل 19 ثانية.
SSCP (واحد حبلا تعدد الأشكال التشكل) أجري تحليل (فارماسيا في مجال التكنولوجيا الحيوية Genephor وفارماسيا في مجال التكنولوجيا الحيوية الآلي هلام الملطخ) من BBS1، BBS2، BBS4 وBBS6 في 15 ° C باستخدام الإجراء العادي.
تم إجراء تسلسل ثنائي الاتجاه للمنتجات PCR المنقى استخدام عدة ABI الكبير صبغ المنهي التسلسل على ABI3100 المنظم الشعرية الآلي (النظم البيولوجية التطبيقية). متوفرة عند الطلب بروتوكولات مفصلة.
مواقع لصق التهديف برامج (http://l25.itba.mi.cnr.it/~web
الجينات / wwwspliceview.html، http://www.fruitfly.org/seq_to
شريان الحياة / splice.html استخدمت) لتقييم تأثير الطفرات التي تؤثر على المواقع لصق وللكشف عن العواقب المحتملة صامتة، أو التغييرات مغلطة والاختلافات intronic على الربط. برنامج التنبؤي، والإنقاذ ESE خادم الويب (http://genes.mit.edu/burgelab/rescue-ese)، وكان يستخدم للبحث عن الأكسون exonic splicing enhancers المحتملة في المتغيرات exonic متعددة الأشكال (المتغيرات الصامتة أو مغلطة).
تحليل الحمض النووي مع الواسمات الوراثية

تم تنفيذ الفصل العائلي من الواسمات الوراثية الفلورسنت STRPs عبر BBS1، BBS2، BBS4 وBBS6 مواضع. متوفرة عند الطلب الظروف التجريبية. تم إنشاء النسخ المتنوعة لكل مريض أو الأقارب ذات الصلة.
وقد تم الحصول على تسلسل الصغرية من موقع UCSC متصفح الجينوم المعلوماتية الحيوية (http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway): للمكان BBS1 (D11S4076، D11S1883، D11S1889)، لمكان BBS2 (D16S3140، D16S408، D16S3071، D16S673)، لمكان BBS4 (D15S1050، D15S204، D15S980، D15S1026) وموضع BBS6 (D20S162، D20S901، D20S160، D20S894).
اثنين الصغرية إضافية، D11S0887 وD11S0406 مترجمة على التوالي 60 كيلوبايت المنبع والمصب 75 كيلو بايت من الجين BBS1 استخدمت (S بهرام وH Inoko اتصال شخصي). A BBS4 داخل الجين (إنترون 4) STRP الصغرية، MIG4، تم استخدام (تانيا Attié، اتصال شخصي). نحن تتميز رواية BBS6 الصغرية داخل الجين STRP (MIG6) مترجمة في إنترون 1 و إجراء التحليل الفلورسنت مع الاشعال التالية 5'-CTCCAACCTGACAGCTAGG-3 "و5'-CCTGCACTTCCTGATAGCC-3".
تحليل كدنا]

تم إجراء تسلسل [كدنا التالية استخراج الحمض النووي الريبي مع RNeasy البسيطة مجموعة (QIAGEN). كان التسلسل الحمض النووي الريبي من المستلفت من I.3 عائلة مع ثلاث مجموعات من الاشعال تغطي BBS1 الترميز بأكمله تسلسل (التفاصيل حسب الطلب).
وصمة عار الجنوبية

تم إجراء تحليل لطخة الجنوبي من الحمض النووي وفقا لبروتوكول الكلاسيكية متوفرة عند الطلب. تم هضم الحمض النووي للالمستلفت من I.5 الأسرة مع الانزيمات تقييد التالية: ECORهين dIII وXba I. استخدمت تحقيقين [كدنا المشعة التي تغطي تسلسل الترميز كامل BBS4 عن التهجين (التفاصيل المتاحة حسب الطلب).

أعلى الصفحة النتائج

تم الكشف عن الطفرات في 14 عائلة، ويمكن أن يتم الكشف عن أي طفرات ل13 عائلة المتبقية (الجدول 1، الشكل 2). تم العثور على سبع عائلات (50٪ من الأسر التي لديها طفرات الكشف) للقيام اثنين من طفرات في الجين نفسه: خمسة لBBS1 (اثنين من أصحاب الزيجوت المتماثلة الألائل وثلاثة الزيجوت المركب)، واحدة للBBS2 (مجمع متغايرة) واحد لBBS6 (مجمع متغايرة). لسبع عائلات، تم العثور على واحد فقط طفرة واضحة أو المفترضة في حالة متخالف: واحد للBBS1، واثنين من لBBS4، ثلاث لBBS6 واحد لBBS7.
الرقم 2.

الأنساب من العائلات المشاركة في الدراسة مع الطفرات المقابلة.
الرقم الكامل وأسطورة (122 K)

الجدول 1 - الطفرات التي تم تحديدها في هذه السلسلة من 27 أسرة.

الجدول الكامل

الطفرات BBS1

وكانت الطفرات BBS1 الحالية في ست من الأسر 27. خمسة من أصل ستة المقابلة الطفرات probant حملت طفرة M390R (تردد أليل في probands BBS = 0.13). هما فقط probands (I.4 وI.6) متماثلة اللواقح بالنسبة للأليل M390R (7.4 مقابل 10.4٪ لدراسة سابقة). 27 في هذه السلسلة، تم تحديد أربع طفرات BBS1 إضافية، منها ثلاث لم يتم تسجيلها سابقا : E384X، R160Q وR429X. التوائم ثنائي الزيجوت المتضررة من عائلة I.15 تحمل كل من M390R وE549X الطفرات. الأخوة يتأثر هو متخالف لطفرة M390R. وأفادت التقارير طفرة E549X سابقا في ولاية متماثل في بويرتو ريكو-الأسر وأيضا في ولاية متخالف مجمع مع الطفرة M390R. 10، 25 يرتبط الطفرة M390R مع E384X في اكسون 12 في الأسرة I.22. والمستلفت الأسرة I.23 يحمل طفرة M390R وc.479G> والتغيير الذي يتوقع طفرة مغلطة (R160Q) التي تؤثر على بقايا الحفظ جدا، ولكنها أيضا الأكثر احتمالا يغير موقع لصق المانحة من اكسون 5، كما أنه يؤثر وG الأخير من اكسون (CG / gtgaga لCA / gtgaga) (الشكل 3). عضوان المتضررين من الأسرة I.3 تحمل طفرة R429X في اكسون 13، والتي من المتوقع أن يؤدي إلى اقتطاع البروتين N-المحطة، ولكن يمكن تحديد أية طفرة ثانية في BBS1، حتى الآن، لهذه الأسرة. وقد ورثت هذه الطفرة من الأب. وأظهر تحليل الواسمات الوراثية في موضع BBS1 أن اثنين من الفتيان المتضررين على حد سواء تتقاسم نفس النمط الفرداني الأمهات. هذه النتيجة يمكن أن تشير إلى وجود طفرة BBS1 التي لم يتم كشفها على أليل الأمهات على الرغم من تحليل RT-PCR وتسلسل الحمض النووي الكامل للتسلسل ترميز BBS1.
الرقم 3.

الحفاظ على تسلسل الأحماض الأمينية حول بقايا تتأثر بالتغيرات مغلطة جديدة في BBS1، BBS4، BBS6 وBBS7، التي تم تحديدها في هذه الدراسة. وقد تم مقارنة تسلسل من البروتينات BBS / أو المنتجات ترجمة توقع من العديد من الأنواع والانحياز. الأحماض الأمينية ذات الصلة هي في جريئة، وشددت عندما مختلفة من هومو الصورة. مرجع؛ يتم تمثيل الهويات الأخرى التي خلفية رمادية. بدائل التطورية في BBS1 (R K) وBBS7 (I V) محافظون. لاحظ التغير في تسلسل في الأنواع بعيدة حول موقف 237 في BBS6. ويظهر الانتقال 480G> A في النوكليوتيدات الأخيرة من exon5 في BBS1 على اليمين. ومن المتوقع أن تغيير موقع لصق المانحة من exon5.
الرقم الكامل وأسطورة (300 K)

الطفرات BBS2

وقد تم تحديد اثنين من الطفرات BBS2 وصف حديثا في نفس المريض (متغايرة المركبة) من عائلة I.8: 627delTT (L209fsX229) و402delT (P134fsX200). تم الكشف عن أية طفرات BBS2 أخرى للمرضى آخرين في هذه السلسلة.
الطفرات BBS4

تغيير L351R في اكسون 13 من BBS4، التي لم يبلغ عنها سابقا، وجد في حالة متخالف في الأسرة I.5 المنشأ السنتي الغجر. تؤثر هذه الطفرة بقايا الحفظ جدا أثناء التطور (الشكل 3)، ويتوقع أن تؤثر على بنية و / أو وظيفة البروتين بسبب استبدال حمض أميني اقطبي من الأحماض الأمينية موجبة الشحنة. على مقربة من كودون 351، وقد وصفت تعدد الأشكال I354T تكرارا أن يؤثر على موقف أقل الحفظ (الشكل 3). وقد ورثت طفرة L351R من الأب، وكان شقيقة تتأثر متخالف لهذه الطفرة. وأظهر تحليل الصغرية في موضع BBS4 أن sibs اثنين ورثت النمط الفرداني الأمهات مختلفة، بالاتفاق مع احتمال تحور BBS4 التي لم يتم كشفها في أليل الأمهات. وكان تحليل لطخة الجنوبي من الحمض النووي للمريض العادي باستثناء لإعادة ترتيب الأهمية على مستوى التسلسل الجيني لBBS4.
لالمستلفت الأسرة I.21، طفرة BBS4 رواية، 1450 + 2delTAGG، تم التعرف على حالة متخالف. ومن المتوقع هذه الطفرة لإلغاء الربط من اكسون 15 من BBS4.
الطفرات BBS6

وقد لوحظت الطفرات متخالف مجمع في BBS6 لالمستلفت (حالة متفرقة) من عائلة I.27 الجمع بين طفرة انزياح الإطار هو موضح سابقا وهي 429delCT433delAG (D143fsX157) وطفرة جديدة S479X. ومن المثير للاهتمام، هذه الطفرة 429delCT433delAG فقط تم ذكر سابقا في المرضى الذين يعانون نيوفاوندلاند في حالة متخالف أو متماثل. 18، 21
الثلاثة الأخرى الطفرات مغلطة BBS6 أو المتغيرات نادرة تم العثور عليها في حالة متخالف لثلاث عائلات إضافية.
تم العثور على مغلطة I339V في المريض الفرنسي متفرقة (الأسرة I.25). هذه الطفرة التي تؤدي إلى تغيير الأحماض الأمينية المحافظ ذكرت سابقا، ولكن pathogenecity لها على ما يبدو مشكوك فيه. 21 تم العثور على أليل واحد تحور في اكسون 3 في موقف 237 (T237P) في الجنين (الأسرة I.20) مع عرض الموجات فوق الصوتية قبل الولادة من المرض مع تشوهات في الكلى وpolydactyly خلف المحور. على الرغم من أن بقايا T237 لا الحفظ جدا أثناء التطور، ومن المرجح أن يكون لها تأثير ضار على الهيكل ثلاثي الأبعاد للبروتين BBS6 (استبدال البرولين الشكل 3). ومن المثير للاهتمام، وهذا الاختلاف هو مجاور للطفرة S236P ذكرت سابقا. 26، 27 لم يتم العثور على طفرة T237P في 48 الضوابط عرقيا يقابل (96 الكروموسومات) أو في 163 probands BBS تحليلها من قبل تسلسل إطار القراءة المفتوح من BBS6. 26
والمستلفت من I.17 الأسرة لديه طفرة T237A الموروثة من الأب ولم يتم تحديدها في السيب تتأثر الثاني. وأظهر تحليل الصغرية أن اثنين من sibs المتضررة تحمل مختلف النسخ المتنوعة الأمهات، باستثناء طفرة ثانية مماثلة في الجين BBS6. تحليل الصغرية في BBS1، كشف BBS2 وBBS4 مواضع أن اثنين من sibs المتضررة لم تشترك في نفس النسخ المتنوعة في كل من هذه الامكنه، باستثناء لهم كما الجينات المرشحة للطفرات biallelic. لم يتم العثور على طفرة T237A في 48 الضوابط عرقيا يقابل (96 الكروموسومات) أو في 163 probands BBS سبق تحليلها. 26
الطفرات BBS7

لBBS7، تم العثور على طفرة I66F واحدة لحالة متفرقة من عائلة I.12، الذي لم يكن لوحظ في 48 الضوابط عرقيا مطابقة أو في 84 مريضا تم تحليلها من قبل الآخرين. 19 ومن المرجح أن يغير من بنية البروتين وهذا التغيير يؤثر على بقايا الحفظ جدا، مثل يسوليوكيني أو حمض أميني أساسي، والأحماض الأمينية مسعور مشابهة جدا توجد في هذا الموقف من الثدييات إلى الخيطية C. ايليجانس (الشكل 3). تأثير هذا الاختلاف الأقرب إلى منطقة بيتا المروحة توقع يبقى، مع ذلك، إلى أن ثبت كما العزل لا يمكن اختبارها في هذه الحالة متفرقة.
الطفرات BBS8

تم الكشف عن أية طفرة لBBS8 لأي من 27 أسرة درس في هذه الوثيقة.
المتغيرات الصامتة يفترض أو الأشكال في جينات BBS

تم الكشف عن العديد من المتغيرات الصامتة يفترض في الإكسونات أو الإنترونات وتلخيصها في الجدول 2. هذه المتغيرات أو لا توقع الأشكال لإنشاء مواقع لصق جديدة، كما تم اختبارها باستخدام مواقع لصق يحرز البرامج.
الجدول 2 - الطفرات exonic صامت والاختلافات intronic لكل الجينات BBS في الأسر المعنية من الفوج.

الجدول الكامل

تم اختبار الطفرات الصامتة exonic والطفرات مغلطة التي كتبها محسن موقع لصق برامج التنبؤية. واحد منهم، المقابلة لتعدد الأشكال المعروفة في اكسون 3 من BBS2 (I123V)، وكان من المتوقع إلغاء موقعا محتملا محسن لصق. ومع ذلك، فإن الدراسات RNA وظيفية يكون ضروريا لاختبار النتائج الفعالة لهذا الاختلاف في RNA الربط. تحديد الأشكال متخالف في المرضى الذين يحملون طفرات متخالف سمح لنا لاستبعاد الحذف في المنطقة الجينومية المقابلة.

أعلى الصفحة نقاش

المرضى الذين يعانون من BBS الحالي مع جمعية فريدة من المظاهر السريرية وتكشف عن عدم التجانس الوراثي ملحوظا. في هذه الدراسة، أجرينا، على سلسلة من 27 أسرة، وفحص الطفرة المنهجي لستة جينات BBS، وهي: BBS1، BBS2، BBS4، BBS6، BBS7 وBBS8. نتائجنا تتفق مع الأدب ملحوظ للتردد تحور BBS1 والكشف المفرط للمرضى حيث تم الكشف عن أليل واحد تحور. على الرغم من عدم المريض في هذه السلسلة أثبتت فصل ثلاثة أليل متحولة، ونحن تقديم أدلة دامغة على وجود نمط digenic (diallelic أو triallelic) من الميراث.
BBS1 والطفرة M390R BBS1

تم الإبلاغ عن BBS1 أن يكون الجين المتحور أكثر في كثير من الأحيان في BBS. وذكر مساهمة واحدة على الأقل BBS1 أليل متحولة سابقا في 23.2٪ من المرضى. 27 هذا هو في تناقض واضح مع دراسات الربط تقدير مساهمة BBS1 مكان لتكون من 32-56٪ من الأسر BBS. 25 في هذه السلسلة، تأسست مساهمة الطفرات BBS1 عن 26٪ من الأسر.
وM390R الطفرة الكبرى (الموجود على اكسون 12 من BBS1) هو BBS1 الأكثر شيوعا تحور أليل لوحظ سابقا في 78-80٪ من الأسر التي لديها طفرات BBS1. 25، 27 وهنا، بالاتفاق مع التقارير السابقة، 5/6 (80٪ ) أسرة، مع الطفرات BBS1 تم العثور على لحمل طفرة M390R (أليلين متماثل كما وثلاثة كما الأليلات متخالف) الذي يمثل طفرة الأكثر شيوعا وجدت في هذه السلسلة من المرضى BBS. يعتبر طفرة M390R أن يكون طفرة القديمة على النحو الذي اقترحه تحليل النمط الفرداني وصفها حصرا في المرضى الذين يعانون من أصل أوروبي. 27 وكان المصدر الرئيسي للأسر التي لديها طفرة M390R الواقع الأوروبي وجميعهم من أصل فرنسي. في هذه الورقة، ونحن تصف ثلاث طفرات BBS1 جديدة وفقا لانخفاض تكرار العائلي أمور من الطفرات "غير M390R BBS1. وقد احدة طفرة BBS1 (E549X) وجدت هنا في عائلة فرنسية الموصوفة سابقا في المرضى الذين يعانون من أصل بويرتو ريكو-ويمكن أن تتوافق مع الحدث الساخنة متكرر. 25، 27
لا طفرة في BBS8

وقد تم تحديد BBS8 مساهمة كبيرة في فهم الآلية المرضية للمتلازمة. ومع ذلك، يمكن أن يتم الكشف عن أية طفرة في سلسلة لدينا. وقد تم تحديد الطفرات متماثل في BBS8 حتى الآن في عائلتين من المملكة العربية السعودية وعائلة باكستانية واحدة. 20
قلة من عائلات أخرى ثنائية أليلية

وقد تم تحديد اثنين فقط من أسر أخرى بشكل واضح مع اثنين من الأليلات تحور في نفس الجين (على التوالي لBBS2 وBBS6). كشفت عائلة واحدة مجمع تغاير لمدة الطفرات هراء في BBS2 (الشكل 1). ومن المثير للاهتمام، والمستلفت هو المريض من الذكور الذين تتراوح أعمارهم بين 20، الذين قدموا مع BBS المظاهر التقليدية (السمنة، في وقت مبكر بداية التهاب الشبكية الصباغي، والتخلف العقلي، وقصور الغدد التناسلية وpolydactyly). ومع ذلك، توفي البكر أخته، منذ أكثر من 25 عاما، في سن 3 أسابيع بسبب موه رحمي مهبلي واسع، مما يشير إلى تشخيص متلازمة مولودية Kusick-كوفمان (MKKS: OMIM 236700) (يمكن إجراء أي تحقيقات الجزيئية لDNA غير متاح). MKKS هو حالة نادرة (كما هو موضح في جمعية polydactyly خلف المحور، موه رحمي مهبلي وتشوه خلقي في القلب)، ذكرت حتى الآن أن يرتبط فقط مع الطفرات BBS6. 16، 22، 28
وأظهرت عائلة أخرى تغاير مركب لمدة اقتطاع الطفرات BBS6. طفرة 429delCT433delAG، وجدت هنا في أسرة فرنسية، إلا أنه قد تم ذكر سابقا في المرضى الذين يعانون نيوفاوندلاند، والتي اقترح لها تأثير مؤسس في هذه الفئة من السكان. المنطقة المعنية هي المتناوب A CT ترينيداد وتوباغو AG T مع احتمال حدوث الاقتران قاعدة القصيرة التي يمكن أن تؤدي إلى إعادة التركيب داخل الجين وحذف AT وAG dinucleotides دون التأثير على النوكليوتيدات TT. 18 هذا التحور يمكن أن تكون الطفرات المتكررة، موضحا من الممكن دي تكرار طفرة نوفو في عائلة فرنسية. المزيد من التحليل باستخدام مرتبطة BBS6 علامات متعددة الأشكال يمكن إنشاء أو استبعاد أحد مؤسسي مشترك محتمل بين الأسر نيوفاوندلاند ولعائلتنا.
متغايرة فائض كشف والميراث قليل الجينات

وعموما، تم العثور على سبعة من 14 عائلة مع طفرات للقيام أليل تحور واحد: ثلاث عائلات لBBS6، عائلتين لBBS4، عائلة واحدة لBBS1 وعائلة واحدة لBBS7. لكل منهما، تم الكشف عن أية طفرة أخرى عن طريق ترتيب تسلسل الترميز بأكمله بما في ذلك مواقع لصق من الجينات المقابلة، ولم يتم اكتشاف أي طفرة أخرى عن طريق فحص الجينات BBS أخرى. ومع ذلك، فإن الطفرة في تنظيم و / أو منطقة غير المكودة، أو الحذف كبير أو غيرها من إعادة ترتيب كبير لا يمكن دائما أن تستبعد من الأساليب المستخدمة في هذه الدراسة على الرغم من أننا القيام بها، عند الاقتضاء، تحليل RT-PCR، تحليل لطخة الجنوبي والصغرية تحديد المفردات. وأثارت هذه النتائج في مسألة تسببها طفرات واحدة: هما واضح (واحد اقتطاع طفرة في BBS1، طفرة لصق واحدة في BBS4)، وثلاثة هي محتملة للغاية (ثلاثة الطفرات مغلطة التي تؤثر على بقايا الحفظ جدا و / أو ينتج عنها غير محافظ الأحماض الأمينية التغيير: واحدة في BBS4، واحدة في BBS6 واحدة في BBS7) وهما المشكوك فيه (I339V وT237A في BBS6).
لهذه الطفرة الماضية، المستلفت الأسرة I.17 كشف طفرة T237A التي كانت، ومع ذلك، لم يتم تحديدها في السيب تتأثر الثاني، مستبعدا تسببها هذه الطفرة إذا اعتبرنا الإرث أحادي الجين الكلاسيكية. سيظل المفترضة الأليلات الأولى والثانية ليتم الكشف عن عائلة I.17. تماما أظهر تحليل الصغرية بالمعلومات أن اثنين من sibs المتضررة لم يحصلوا على نفس مجموعة من الصبغيات الأبوية في موضع BBS6. لم تحليل الطفرة لم تكشف عن أي طفرة في تسلسل الترميز ولصق تقاطع الجينات BBS أخرى اختبارها في هذه الوثيقة. وعلاوة على ذلك، وتحليل الصغرية في BBS1، BBS2 وBBS4 مواضع استبعاد لهم كما الجينات المرشحة للطفرات biallelic.
ومن المثير للاهتمام، فإن المريض يحمل طفرة T237A BBS6 قدم مع ميزات BBS نموذجية بالإضافة إلى نقص تنسج الخلقية من قوس الأبهر خلافا لالسيب المتضررين الآخرين الذين كشف ملامح BBS الكلاسيكية وقوس الأبهر العادي.
دراسات أخرى ومع ذلك، فقد أظهرت أن الأشقاء يمكن أن يكون مخالف للأليل الثالث تحت فرضية triallelic. على سبيل المثال، Badano وآخرون 7 وصف عائلتين مع الطفرات في BBS1 فيها بعض وليس كل sibs المتضررة تحمل طفرة ثالثة في أي BBS2 أو BBS6، الذي يبدو لتعديل النمط الظاهري. وفي الآونة الأخيرة، فان وآخرون 12 وصف تأثير التعديل بسبب طفرة مغلطة للBBS3 في واحدة شقيقة المتضررين من شقيقتين تحمل طفرة M390R في ولاية متماثل. وقد تم تحديد الطفرات واحدة متخالف في BBS5 في الأنساب القوقازية، مما يشير أيضا مشاركة هذا الجين في الميراث معقدة. 15
وقد اعترف كل من الميراث راثي متنحي (الميراث مكان واحد) والميراث قليل الجينات (الأليلات محددة في مكان واحد أو أكثر التي تؤثر على سمة وراثية) تحدث في BBS. وقد شكك جسمية التقليدي الميراث المتنحية كما Katsanis آخرون وصفت مؤخرا أنه بالنسبة لبعض الأسر BBS، ما مجموعه ثلاثة طفرات في اثنين من الجينات ضرورية للتعبير السريرية. 25، 27
تم الإبلاغ عن BBS6، BBS2، BBS3، BBS5، BBS4، BBS1 وBBS7 أن تشارك في triallelism مع ميل للBBS6 وBBS2. 27 والأليلات الثالثة التي أعلن عنها في الأدب و، ومع ذلك، والطفرات في كثير من الأحيان مغلطة التي المرضية يمكن أن يكون في بعض الأحيان من الصعب التأكد.
في الواقع، في سلسلة من 96 الكروموسومات السيطرة، حددنا طفرة مغلطة، A242S، التي تم وصفها سابقا في أسرة بالتعاون مع طفرة BBS2 متماثل. 26 تم العثور على هذه مغلطة أيضا مرة واحدة في 330 الكروموسومات السيطرة اختبارها. 26
في هذه السلسلة، لم نتمكن من تحديد الأشقاء تتأثر الأفراد المتضررين الذين يحملون طفرات اثنين في واحد BBS مكان. يمكن إثبات أي من 27 أسرة تحليلها هنا لمدة ستة جينات BBS عن تقديم الميراث قليل الجينات الكامنة وراء حقيقة أن هذا النمط من الميراث ليس هو القاعدة لBBS. ومع ذلك، لا يمكن استبعاد الميراث triallelic في سبع عائلات مع أليل تحور واحد المكتشفة في هذه السلسلة. وعلاوة على ذلك، لدينا فوج من 27 أسرة صغيرة بالمقارنة مع 259 أسرة من مختلف الأعراق درس حتى الآن من قبل الآخرين. 26 التعرف على الجينات BBS في عداد المفقودين، وتحليل الفصل في الأسر إضافية وتطوير الاختبارات الوظيفية للتأكد من تأثيرات التغيرات مغلطة ستكون ضرورية لتوضيح مسألة التردد في الميراث triallelic في BBS. البيانات المتوفرة لدينا هي paradoxal في الطريقة التي تزيد من الزيجوت هو موح من الميراث قليل الجينات في عدد ملحوظ من الأسر. ولكن، مع ذلك، في هذه السلسلة، وقد تم تحديد أي مريض triallelic واضح. مع الأخذ بعين الاعتبار أن نصف عائلاتنا لا تحمل طفرات في الجينات المعروفة BBS (باستثناء BBS5 وBBS3 حددت مؤخرا)، وأدلة دامغة لtriallelism، فإننا نقترح أن تظل مواضع BBS إضافي ا لكشف عن هويته.

 

__________________
استشارى الادوية الطبيعيه وباحث وخبير فى علاجات التوحد
رد مع اقتباس